ТорчКрафт: Унифицированная конструкция связующего устройства путем предотвращения всеатомного прогнозирования структуры

arXiv:2609.19770v1 Annualce Type: New Humber Brieflow: Всеатомные предсказания структуры моделируют различные молекулярные взаимодействия, но использование их усвоенных структурных предпочтений для дизайна вяжущего материала по-прежнему сопряжено с трудностями. Здесь мы представляем ForchCraft, унифицированную систему создания папок-конструкций, которая оптимизирует последовательность логитов через замороженный всеатомный прогнозор. В Торчфольде, TorchCraft сочетают в себе цель уверенности, контакта, геометрическую и последовательность в рамках общей процедуры оптимизации для мини-биндеров, с кондиционированных VHH, циклических пептид и связывающих белков. Используя предварительно подготовленные " Альфафольд-3 &qt; , Торчкрафт создал репрезентативные мини-байндеры и VHH с экспериментальным измерением связывающих друг друга четырех целевых показателей в каждом формате без последующей реорганизации последовательности. Расчетные контрольные показатели также продемонстрировали применимость рамок к циклическим пептидам и карманному дизайну с конструкцией лиганда. ТорхКрафт распространяет инверсию прогнозора на несколько форматов папок и молекулярный контекст, провин