Биология на месте: Амортизированная адаптивная хит-детекция в CRISPR Screens
arXiv: 2609.11877v1 Annuales Type: New Habstratement: Многие проблемы с биологическим обнаружением требуют, чтобы эксперименты отбирались последовательно при ограниченных бюджетах. Одним из наглядных примеров является проверка CRISPR, поскольку исчерпывающие тесты на поражение зачастую неосуществимы и в первую очередь могут быть выбраны кандидаты. Несмотря на важность этой проблемы, существующие контрольные показатели для адаптивного обнаружения ударов по-прежнему ограничены в масштабах и разнообразии. Здесь мы представляем AssayBench-Loop, крупномасштабный эталонный показатель для адаптивного обнаружения хитов, включающий 1389 экранов CRISPR по пяти категориям фенотипа. Помимо того, что он позволяет проводить систематическую оценку, его масштабы позволяют изучать стратегии приобретения в ходе исторических экспериментов. Основываясь на этом ресурсе, мы представляем AssayLoop — последовательную экспериментальную схему дизайна, объединяющую AsseyFormer, основанную на трансформаторе амортизированную политику приобретения, обученную по всем историческим экранам для адаптации с помощью экспериментальной обратной связи с LLM-
