Количественная биология > Народонаселение и эволюция [Представлено 11 сентября 2026 года] Название: ГрассТоп: Грасманнская к-мера Топология для классификации вирусов и филогенетического анализа PDF HTML (экспериментальный) Резюме: Мы представляем GrassTop — геномное представление, интегрирующее грасманнские коллекторы и алгебрайк5 топологию для вирусной классификации и филогового анализа. Эта система начинается с построения тиалистических и спектральных дескрипторов (k)-мерометровых позиционных схем. Затем он извлекает подпространство низкого уровня 7, которое резюмирует вариации по фильтрации и сравнивает геномы с дистанцией Грассманна 8. Хотя в отчетности об осуществлении используется дистанция хорда, рамки не являются ре-9 жесткими с учетом этого конкретного выбора. Мы оцениваем GrassTop на четырех семействах наборов данных по вирусной классификации10, четырёх филогенетических групповых наборов и экспериментом в области секвенирования. В соответствии с указанным протоколом 5-11 по соседству " ГрассТоп &qt; получает более высокие оценки, чем пять опубликованных безотносительных справочных методов12 во всех сообщаемых классификационных показателях и наборах данных. Его деревья UPGMA (невзвешенная пара-группа 13 с использованием арифметических средних значений) достигают средней чистоты этикеток 1,0 на каждом наборе данных по филогенетике14. Эксперимент по транстурбации позволяет получить более нюансированный результат: подпространственное представление диф-15 флаеры…
Грасс-Топ: грасманская топология для классификации вирусов и филогетического анализа
arXiv: 2609.13341v1 Annualce Type: New Humber Abstract: Мы представляем GrassTop — геномное представление, которое объединяет грасманнские коллекторы и алгебраицю для вирусной классификации и филогенетического анализа. Эта система начинается с построения тиалистических и спектральных дескрипторов (k)-мерометровых позиционных схем. Затем он извлекает подпространство низкого уровня 7, которое резюмирует вариации по фильтрации и сравнивает геномы с дистанцией Грассманна 8. Хотя в отчетности об осуществлении используется дистанция хорда, рамки не являются ре-9 жесткими с учетом этого конкретного выбора. Мы оцениваем GrassTop на четырех семействах наборов данных по вирусной классификации10, четырёх филогенетических групповых наборов и экспериментом в области секвенирования. В соответствии с указанным протоколом 5-11 по соседству " ГрассТоп &qt; получает более высокие оценки, чем пять опубликованных безотносительных справочных методов12 во всех сообщаемых классификационных показателях и наборах данных. Его UPGMA (невзвешенный метод с использованием арифметической группы 13)