Прогнозирование гибкости направления в белках

arXiv: 2609.08474v1 Annualce Type: New Brieflow: Прогнозирование динамики протеинов является давнишней проблемой в вычислительной структурной биологии. Часто функция белка в решающей степени зависит от местных движений, таких как движения петель, реструктуризация каталитической цепи и переориентация доменов, которые могут характеризоваться гибкостью направления и корреляционными структурными движениями позвоночника. В то время как моделирование молекулярной динамики (MD) обеспечивает установившийся, но зачастую непомерно дорогостоящий подход, последние глубоко-генеративные модели направлены на снижение этой стоимости путем прямого прогнозирования конформационных анамблей и имитации MD. Однако из-за их большого размера и необходимости генерировать несколько государств до тех пор, пока производные динамические свойства не сойдутся, эти модели остаются дорогостоящими. В этой работе мы предлагаем BackFlip-2: быстродействующая графическая сеть SE(3), обученная прямо предсказывать динамические дескрипторы, такие как гибкость направления позвоночника и двухсторонние динамические корреляции от