Количественная биология > Прочая количественная биология [представлена 10 сентября 2026 года] Название: SenSASP: Единая многолайерная база данных о сенсации и SASP Genes View Резюме: Поиск по клеточной сейнсии и секретному фенотипу, связанному со сенсорностью (SAsp), опирается на независимые генетические ресурсы, отличающиеся друг от друга в плане охвата, идентификаторов и циклов обновления, что делает ошибки в интеграции между ресурсами более вероятными. Мы объединили четыре широко используемых ресурса: CellAge, Genaage, сигнатуру Сенмайо и реактомную клеточную чувствительность на единый канонический идентификатор (идентификатор гена Энсембля) и обогатили каждый ген тремя слоями аннотации, отсутствующими во всех четырех входных данных: межвидовым сохранением, тканью и выражением типа клеток, а также высокодоверным взаимодействием белков-протеинов. Объединение разрушило 1 460 записей источника в 1250 уникальных генов (210 ненужных позиций удалены, 14,4%) при сохранении полного происхождения источников: 173 гены подтверждаются двумя или более ресурсами и 2 (IL6, JUN) всеми четырьмя. Три слоя аннотации достигают 95,8%, 97,9% и 93,0% генов, из которых 89,4% являются аннотированными по всем трем. Случайная выборка карт идентификаторов 500-ти летних была подтверждена на основе данных HGNC и Ensembl (точное совпадение 98,0%). Результатом этого является единая, машиночитаемая база данных о гармонизированных идентификаторах и новом сетевом функциональном контексте, которая…
SensASP: Унифицированная база данных по сенсациям и генам SASP
arXiv:2609.13322v1 Annuate Type: New Brieflow: Institutive on cellotal senessence and the Security-sense (SASP) использует независимые кранированные генетические ресурсы, которые различаются по охвату, идентификаторам и циклам обновления, делая ошибки в интеграции между ресурсами более вероятными. Мы объединили четыре широко используемых ресурса: CellAge, Genaage, сигнатуру Сенмайо и реактомную клеточную чувствительность на единый канонический идентификатор (идентификатор гена Энсембля) и обогатили каждый ген тремя слоями аннотации, отсутствующими во всех четырех входных данных: межвидовой консервацией, тканью и выражением типа клеток, а также высокодоверным взаимодействием белков-протеинов. Объединение разрушило 1 460 записей источника в 1250 уникальных генов (210 ненужных позиций удалены, 14,4%) при сохранении полного происхождения источников: 173 гены подтверждаются двумя или более ресурсами и 2 (IL6, JUN) всеми четырьмя. Три слоя аннотации достигают 95,8%, 97,9% и 93,0% генов, при этом 89,4% аннотированно по всему thr.