Поколение с целью прогнозирования клеточной реакции на гены

arXiv: 2603.07233v2 Annuales Type: заменить резюме: прогнозирование транскрипционных ответов на генетические нарушения имеет основополагающее значение для функциональной геномики и терапевтического открытия. Недавние модели глубокого обучения показали многообещающесть в прогнозировании реакции на разрозненные клетки, но они обычно генерируют каждый ответ изолированно без явного воздействия соответствующих возмущений. Мы введём PT-RAG (Двухэтапное поколение с двумя стадиями ретровиваля) — модуль поиска и кондиционирования для реакции на эмбриональные клеточные возмущения. PT-RAG дополняет существующую опору для реагирования на возмущение и позволяет получать знания о доступе к соответствующим контекстам. Ключевая задача заключается в том, что актуальность не закреплена в этой среде: функционально связанные гены могут вызывать различные эффекты различных типов клеток. PT-RAG рассматривает это с помощью двухэтапного механизма поиска: на основе GenePT семантическое поиск сначала выявляет K-проблемы, после чего отличный выборщик Gumbel-Softmax