Количественная биология > Genomics [Представлено 10 сентября 2026 года] Название: scPyviewer: a Python-nature зритель из AnnData interactive data betre Indate: Moviation: Interactual web-инструменты, позволяющие непрограммистам изучать одноклеточные наборы данных, встраиваемые гены, выражение генов, метаданные и маркеры являются стандартной лабораторной инфраструктурой. Тем не менее, активно поддерживаемые инструменты (например, ShinyCell, scRDAVis, sCIRCLE) полагаются на R Singy и требуют сератных объектов. Python/scanpy, доминирующая основа для одноклеточного RNA-seq и пространственного анализа, не имеет легковесного местного опциона, сочетающего делимитируемого зрителя с скриптом Pyhon API. В настоящее время обмен результатами сканирования требует перевода в Seurat или обмена записными книгами кодов. Результаты: Мы представляем сппивизор, веб-сервер который непосредственно поглощает объекты Энн Дейта и воспроизводит действующие модели взаимодействия в Python Stack. В ходе проверки по принципу паритета характеристик на основе трех инструментов R Shiny, сквилер соответствует или превышает базовые возможности (7/7), предлагая уникальное предложение о включении местных ан-Data без преобразования и сопоставления перекрестных наборов данных по совместно используемым генам и соответствующим типам клеток. Контрольные тесты по трем наборам данных (22 315 ~ 313 000 ячеек) показывают, что скп-визор делает каждый вид быстрее (до 3,6x ускорения), используя более низкую память (5.2 x…
ScPyviewer: Python-nault Interactive зритель из AnnData данных с одной клеткой
arXiv: 261 030.35890v1 Annualce Type: New Humanitary: Interactive web-инструменты, позволяющие непрограммистам изучать наборы данных с одной клеткой, встраиваться, выражения генов, метаданные и маркеры являются стандартной лабораторной инфраструктурой. Тем не менее, активно поддерживаемые инструменты (например, ShinyCell, scRDAVis, sCIRCLE) полагаются на R Singy и требуют сератных объектов. Python/scanpy, доминирующая основа для одноклеточного RNA-seq и пространственного анализа, не имеет легковесного местного опциона, сочетающего делимитируемого зрителя с скриптом Pyhon API. В настоящее время обмен результатами сканирования требует перевода в Seurat или обмена записными книгами кодов. Результаты: Мы представляем сппивизор, веб-сервер который непосредственно поглощает объекты Энн Дейта и воспроизводит действующие модели взаимодействия в Python Stack. В ходе проверки по принципу паритета характеристик на основе трех инструментов R Shiny, скпайтвьюер соответствует или превышает базовые возможности (7/7), предлагая в уникальном порядке местные продукты питания Анн Дейта без преобразования и сопоставления перекрестных наборов данных по совместно используемым генам и м